黄晓军于1987年毕业于中山医科大学医疗系；1992年获得北京医科大学获医学博士学位；1997—1998年在美国阿尔伯特·爱因斯坦医学院肿瘤研究中心从事血液恶性肿瘤新的研究；2005年任北京大学血液病研究所所长 ；2007年获得“国家杰出青年科学基金”资助；2012年入选“科技北京百名领军人才”；2013年入选“国家百千万人才工程”；2017年3月入选“中国十大医学新闻人物”；2022年当选为中国医学科学院学部委员；2023年当选法国国家医学科学院外籍通讯院士；2023年11月，当选为中国工程院院士。
黄晓军教授长期聚焦白血病等其他恶性血液疾病的前沿研究和临床，创建骨髓移植中国科学新方案—“北京方案”，解决了“供者来源匮乏”这一世界性医学难题，使亲属成为移植供者的概率由不足25%上升至接近；显著提高了患者生存，使半相合移植白血病的3年生存率从约20%升至70%左右。北京方案改变了世界半相合移植“不可逾越”的传统观念，使半相合移植成为白血病一线方案，促进了全球白血病和骨髓移植学科的在近20年的长足进步。
北京大学人民医院血液科黄晓军专家门诊在线咨询。黄晓军，北北京大学人民医院，血液病研究所主任医师，教授，博士生导师，医学博士。临床擅长于血液系统疾病，造血干细胞移植后的移植物抗宿主病、感染和复发等各种移植合并症的诊断和处理，如白血病、地中海贫血、骨髓移植等疾病。主持国家863计划、国家杰出青年基金、国家自然基金重点项目等多项国家课题，以通讯或作者发表SCI论文270余篇，入选2014、2015年中国高被引学者榜单，获国家科技进步二等奖1项、省部级一等奖4项、吴阶平医药创新奖。
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【社会任职】
《中国实用内科杂志》副主编
《中国学杂志》副主编
《中华医学杂志英文版》编委
《中华医学杂志》编委
《中国医学论坛》报血液肿瘤专刊副主编
《国际输血及血液学杂志》编委
《中国实验血液学杂志》副主编
血液学分会常务委员
北京医师专家委员
北京市血液肿瘤专业委员