木托盘有可能存在病虫害。因此，从防止病虫害的传播，无论是出口还是进口的木质包装箱托盘，必须经过熏蒸处理，并且有木托盘供应商提供的熏蒸热处理证明，否则没有熏蒸证明无法报关出口。
木托盘的好处：
木托盘运输适宜于包装杂件小件，利于装卸和机械化作业；可以减少货物因装卸而产生的破损；包装的货物捆扎紧实可以确保货物不遗漏；包装可以适应机械化作业，提高工作效率和运输速度；可以节省包装材料，节省运输费用；木托盘价格相对便宜；维修比较简单。总得来说木托盘度高、不易变形，用高强度螺钉加固，不会起钉，牢固性好。抗弯强度大，刚性好，承载能力大，成本低，易于维修，耐低温和高温性能好，适用范围广。
木托盘缺点：
木托盘不防火、不防水、易受潮、易生虫、易腐烂；一次性出口包装材料时，须进行熏蒸或热处理，增加额外费用，延长通关时间；制作木托盘需砍伐大量森林，与环保主题背道而驰；由于木材是天然材料，其质量受地域气候等多方面影响，即便是同一批原料，在干湿度、风裂等方面亦难以达到统一标准。
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