木托盘的处理方式：
1.防霉：使用专业的木材防霉剂对其处理，可以采用快速浸泡或者喷刷等方式处理，但是防霉剂的成本价格很高，并且对操作人员以及工作环境容易造成伤害和污染。
2.防潮剂：现在国际上通用放置集装箱干燥剂（货柜干燥剂）来防止受潮，为防止潮气渗入，可以用吸湿较强的氯化钙干燥剂，放在集装箱内，其次装箱前检查集装箱是否用水冲洗过，采取了干燥处理没有。
3.热处理：要有木托盘专门的设备，而且处理成本高，可以降低木材中水份含量，但不能解决根本问题。
4.烘干：此方法可以解决大部分问题，但是成本价格昂贵，并且容易导致木材出现裂纹，但特殊的用途比如密封包装，仓库湿度大，出口时在海上湿热环境等等情况下就不管用了。空气干燥（自然晾干）成本低，但是耗时长。
5.熏蒸：此方法主要是针对出口的木质包装进行杀虫，而且有效期比较短。很多误以为是防霉，其实它对霉菌的防治一点效果都没有的。
6.防腐：此方法主要是针对室外应用的景观木或者家具木处理，常用的药水为ACQ和CCA等，采用真空高压的方式把药水打到木材里边，一般渗透比较厚，主要是防虫杀等等，但其对霉菌效果不怎么好，往往看到景观木发霉的到处都是。
木托盘有可能存在病虫害。因此，从防止病虫害的传播，无论是出口还是进口的木质包装箱托盘，必须经过熏蒸处理，并且有木托盘供应商提供的熏蒸热处理证明，否则没有熏蒸证明无法报关出口。
木托盘经过了抛光，使板面的质量有了很大的改善，但木托盘的周边仍露出了芯材，这不仅影响美观，并且在使用过程中容易吸收空气中的水分，引起覆面材料脱胶、开裂、剥落等缺陷，大大缩短使用寿命，因此封边加工技术是木托盘生产中不可缺少的一个工序。
一些叉车工在实际的叉车移动木托盘时，通过叉车两叉对木托盘进行撞击推动，其结果就是使得木托盘上的货物因此倒塌甚至是损坏，缩短木托盘的使用寿命，叉车的不当操作是造成托盘损坏的主要因素，约占80﹪以上;木托盘本就是木材制成的托盘，长期放置在仓库里存储时,，容易出现虫蚀、受潮等情况，也会大大缩短木托盘的使用寿命……使得原本能用5年的木托盘，其使用寿命缩短到了12个月，甚至是更短。