苗期管理苗期应经常观察苗地情况，遇旱及时浇水，保持苗床湿润，雨季注意排水，防止积水。种子苗在小苗长至2～3对真叶时要及时进行间苗，按株距5厘米留苗。苗期除草2～3 次，施肥2 次～3 次，以薄施氮肥为主。每公顷每次施腐熟农家水肥15000 kg或尿素150kg兑水淋施。一年生苗株高达15厘米，茎粗达0.2厘米以上可以出圃。
传统的采收方法以采收全株为主，药典所载也是以全株药用，草珊瑚野生分布地多为肥沃疏松的土壤，且根系浅，易于连根拔起，这种采集方法对草珊瑚药材资源是毁灭性的，是不可持续的。在人工栽培条件下，如采用采收全株的方法，也会大大增加种植年限和种植成本，而获得的产量并无明显增加。一般草珊瑚药材根部重量约占全株重量的10%左右，如果采收植株地上部分，虽然产量稍低，但每年都有收成，又能降低生产成本，达到可持续生产的目的。
在人工栽培条件下，应在种植3年后采收药材为好，草珊瑚药材有效成分异嗪皮啶含量在9月和10月较高，因此草珊瑚药材采收时间在每年的9月～11月份较适宜。在广西的自然条件下，9月～11月气候相对比较干燥，降雨少，植株的水分含量相对较低，此时开展药材采收工作，也有利于药材的干燥保存，方便运输。草珊瑚药材采收后在干净的晒场上晒干，有条件的也可进行烘干，即可作为原料药材出售。
经初加工的草珊瑚药材应用清洁、透气的包装袋包装。包装上应有清晰、牢固的标识，标识的内容含生产单位、产地、品种名称、采收日期、包装日期、联系方式等。药材经包装后应放置在干燥、阴凉、通风处贮藏。运输药材的工具必须清洁、干燥、无异味、无污染，运输过程中应注意防雨、防潮，同时不得与其它有毒、有害、有污染、易串味的物质混装。
草珊瑚刚从野生转为家种，抗病虫能力较强，目前尚未发现为害较重的病虫害，无需防治。但如果田间遮荫条件差、在阳光强烈的夏季，会出现叶片灼伤现象，叶尖或叶绿出现斑枯，严重的全叶枯焦。可采用灌水降温、改善遮荫条件等措施，以减轻为害。