做到利益均衡，应该是物流专线联盟的一个关键点。这就意味着联盟公司总公司一定要有盈利能力，能够让加盟公司老板从联盟中得到利益，千万不能触碰联盟参与公司原有股东利益。此外，要注意设立进入和退出机制，联盟机制容易出现的问题就是“七嘴八舌”，联盟成员的意见不一易导致联盟崩盘，这一点也容易让联盟成员在联盟成立之初心存外心，因此，联盟一定要先设定好进入和退出机制，在联盟不能明确成功之前，各个参与股东除损失股份投资的部分资金以外，其他品牌和业务都不会受到影响，除了资源整合、利益分配之外，由于联盟成员各自的规模和投入资源差异，各地区域情况差异，因此需要清晰地明确权、责、利。付出和收益一定要实现规范、科学。其中，必须遵循共生法则，作为专线物流联盟的推动者，就是要让被整合对象都有自己更大的生存发展空间，而不是被整合消亡。所有物流联盟的参与者，思维上需要开放，不要外表整合，内在各自为政。
其次，还要加强运营团队的融合重建和信息系统的整合。传统模式下，专线物流运输时效性差的原因在于车辆调配与专线整合，中转、分拨、再中转，这过程中如果能够实现物流信息化平台的整体应用，将更多符合要求的货运车源更好地适配与整合，通过大平台的平滑过渡与事前匹配，提升专线物流车辆的利用率，提升整个专线运输的时效性，是专线物流今后发展的核心方向。信息化的充分利用，有利于减少线路空载，促进业务流程的信息化管理，改善专线物流在价格与利益的平衡上左右为难的现状。